Пару раз уже сталкивался с тем что нормальный конфиг 3proxy не работает.

nserver 8.8.8.8
nserver 2001:4860:4860::8844
timeouts 1 5 30 60 180 1800 15 60
daemon
log /var/log/3proxy/3proxy.log D
logformat "- +_L%t.%.  %N.%p %E %U %C:%c %R:%r %O %I %h %T"
auth strong
users test:CL:test
allow test
socks -6 -p1000 -i{IPV4} -e{IPV6}
socks -6 -p1001 -i{IPV4} -e{IPV6}

Так вот, конфигурация работает, просто не нужно тестировать через Proxifier, SocksCap, WinCap.
Проблем c 3proxy нет, есть проблемы только у данных программ.
Хороший IPv4 to IPv6 Proxy чекер вот : https://proxy6.net/en/checker
Через него проверяем работоспособность конфига.